ณ จุดเริ่มต้นของเรื่อง โฮชิโนะ เท็ตสึโร่ (Hoshino Tetsuro) เด็กผู้ชายอายุประมาณ 10 ปี มีชีวิตอยู่อย่างยากจนบนโลกอนาคตอันห่างไกล โลกซึ่งมนุษย์ที่ไม่ใช่เครื่องจักรกลมีฐานะยากจน ถูกกดขี่ข่มเหง และกำลังถูกกำจัดให้สูญหายไป เขาและแม่อาศัยในเพิงเล็ก ๆ และยุ่งอยู่กับการเตรียมตัวสำหรับฤดูหนาวอันโหดร้ายที่กำลังจะมาถึง แต่แล้วเกมส์ล่าชองมนุษย์จักรกล เคาท์ เม็กคา (Count Mecha) และพวกก็มาถึงพวกเขาโดยไม่คาดฝัน มันเหมือนกับมนุษย์จักรกลเหล่านั้นได้เจอกวาง พวกนั้นได้ฆ่าแม่ของเท็ตสึโร่ และนำร่างของเธอไปด้วยเป็นรางวัล เท็ตสึโร่สาบานว่าจะแก้แค้นพวกนั้นให้ได้
เขาต้องการที่จะมีร่างกายจักรกลที่ไม่สามารถทำลายได้ เพื่อที่จะแก้แค้นให้แม่ของเขาได้ แต่ก็เหมือนความฝันอันห่างไกล เพราะร่างจักรกลนั้นมีราคาแพง เขารู้มาว่า ณ จักรวาลอีกด้านหนึ่ง มีดวงดาวที่สามารถทำร่างของเขาให้เป็นจักรกลได้ฟรี และรถด่วนอวกาศ 999 ก็จะพาเขาไปได้ เมื่อได้โอกาส เขาขโมยบัตรผ่านขึ้นรถไฟ และตำรวจก็ตามจับเขา ขณะที่เกือบจะโดนจับได้ เท็ตสึโร่ก็ได้พบกับเมเทล (Maetel) ผู้หญิงสวยผมสีทอง สวมชุดสีดำสนิท ผู้ซึ่งทำให้เขารู้สึกประทับใจเหมือนแม่ของเขา เมเทลมาช่วยเขาไว้ได้ทัน และได้ให้บัตรผ่านขึ้นรถด่วนอวกาศ 999 (Galaxy Express 999) แก่เขา เธอบอกเขาว่า รถด่วนอวกาศ 999 เป็นรถไฟที่สามารถพาเขาจากกาแล็กซี่ทางช้างเผือกไปยังกาแล็กซี่แอนโดรมีด้า ที่นั่นมีดาวซึ่งสามารถทำร่างกายของเขาเป็นจักรกลได้ฟรี เงื่อนไขการให้บัตรผ่านนี้มีเพียงว่า เขาจะต้องให้เธอติดตามไปด้วย แม้จะดูลึกลับ แต่เท็ตสึโร่เห็นว่า บัตรนี้เป็นโอกาสเดียวของเขาที่จะไปจากโลก ได้เห็นจักรวาล และมีร่างกายจักรกลที่เขาต้องการ
ในการเดินทางของเท็ตสึโร่ เขาได้พบกับทุกสิ่งทุกอย่างไม่ว่าจะเป็นมนุษย์จักรกล ผี คิงคองตัวโตแต่สุภาพอ่อนโยน มนุษย์ใต้บาดาล มนุษย์แมลง และแม้กระทั่งไดโนเสาร์ และเขาได้เห็นดาวจักรกล ดาวที่เป็นฤดูร้อนเสมอ ดาวที่เป็นฤดูหนาวเสมอ ดาวที่เต็มไปด้วยหมอก ดาวที่มีฉายแสงเหมือนทอง ดาวที่มีแผ่นดินไหวอยู่ตลอดเวลา ระหว่างการเดินทางนี้เอง เขาได้พบกับ เคาท์ เม็กคา ที่ฆ่าแม่ของเขา และได้แก้แค้นด้วยด้วยปืนที่เมเทลให้ยืม
เรื่องราวดำเนินต่อไป เขาหยุดแวะดาวแล้วดาวเล่า เท็ตสึโร่เริ่มเห็นว่า การมีร่างกายจักรกลไม่ใช่ช่วยแก้ปัญหาอย่างที่เขาเคยคิดไว้ ในความเป็นจริงแล้ว มนุษย์จักรกลที่เขาพบเจอล้วนแต่ขาดแคลนแรงผลักดันสู่ความสำเร็จอย่างที่มนุษย์ปกติมี ขาดแคลนความต้องการที่จะสร้างสรรค์บางสิ่งที่มีค่า มีความหมายภายในช่วงชีวิตอันสั้นของมนุษย์ปกติ มนุษย์จักรกลส่วนใหญ่ที่เขาพบมักเสียใจกับการตัดสินใจละทิ้งความเป็นมนุษย์ ที่น่าสงสารที่สุด คือ คริสตัล แคลร์ (Crystal Clare) ผู้ทำงานบนรถด่วนอวกาศ 999 นี้ ร่างเปลือยของเธอดูเป็นคริสตัลใสสวยงาม แต่เธอก็อยากมีความอบอุ่นของสัมผัสมนุษย์อย่างเท็ตสึโร่มี
ขณะเดินทางไปกับเมเทล เท็ตสึโร่เริ่มประหลาดใจว่าจริง ๆ แล้ว เมเทลเป็นใครกัน เธอมักมีอารมณ์เศร้าเสมอ และเขาเริ่มรู้สึกว่าการเดินทางของเมเทลไม่เคยสิ้นสุด เธอน่าจะเคยมีเพื่อนร่วมทางมาก่อน และเขาก็รู้ว่าเธอจะมีเพื่อนร่วมทางใหม่อีกในอนาคต ซึ่งบางตอนในเรื่อง ก็ทำให้เข้าใจว่า เมเทลมีร่างจักรกลเช่นกัน เพราะเธอได้ไปเยี่ยมร่างมนุษย์ของเธอบนดาวพลูโต ที่ซึ่งร่างมนุษย์ที่ถูกละทิ้งได้รับการห่อหุ้มไว้ด้วยน้ำแข็งในสุสานขนาดใหญ่ เมเทลบอกว่า เธอจะต้องเดินทางอย่างไม่มีวันจบสิ้นไปกับเด็กชายเช่นเดียวกับเท็ตสึโร่
ตัวละครจากงานเขียนอื่น ๆ ของมัตสึโมโตได้ปรากฏในเรื่องนี้ ไม่ว่าจะเป็น กัปตัน ฮาร์ล็อค (Captain Harlock), เอเมอร์รัลดาส์ (Emeraldas), เรือ sans crew จากเรื่อง เรือรบอวกาศยามาโตะ (Space Battle Ship Yamato หรือ Aka Star Blazers) และอื่น ๆ อีก ที่สร้างต่อเนื่องกันจนได้รับการกล่าวขานว่าเป็น Leijiverse
หนังสือการ์ตูน (Manga Series)
ลิงค์ที่เกี่ยวข้อง GE 999 Flash Animation1 GE 999 Flash Animation2 GE 999 Flash Animation3
แหล่งข้อมูลอ้างอิง http://absoluteanime.com/captain_harlock/index-ge999.htm http://www.mit.edu:8001/people/rei/MANGA/999.html http://en.wikipedia.org/wiki/Galaxy_Express_999